HMMER2.0 [2.3.2] NAME Subfamily.Smoe1.KD LENG 70 ALPH Amino RF no CS no MAP yes COM /opt/Bio/hmmer/bin/hmmbuild -f -n Subfamily.Smoe1.KD ./Subfamily.Smoe1.KD.hmm ./Subfamily.Smoe1.KD.aln COM /opt/Bio/hmmer/bin/hmmcalibrate ./Subfamily.Smoe1.KD.hmm NSEQ 9 DATE Mon Sep 20 14:18:36 2010 CKSUM 2106 XT -8455 -4 -1000 -1000 -8455 -4 -8455 -4 NULT -4 -8455 NULE 595 -1558 85 338 -294 453 -1158 197 249 902 -1085 -142 -21 -313 45 531 201 384 -1998 -644 EVD -9.296091 0.676272 HMM A C D E F G H I K L M N P Q R S T V W Y m->m m->i m->d i->m i->i d->m d->d b->m m->e -415 * -2000 1 -2228 -1908 -3555 -3373 -604 -3255 -2515 -62 -2963 2976 358 -3207 -3275 -2644 -2802 -2988 -2232 -567 -1904 -1643 9 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - -32 -6683 -7725 -894 -1115 -701 -1378 -1415 -7109 2 -2323 -2419 -1868 -1956 -1368 -2396 5124 -3143 -1645 -2924 -2595 -1989 -2806 -1873 -1712 -2381 -2439 -2923 -1719 -935 10 - -149 -500 233 43 -381 399 106 -626 210 -466 -720 275 394 45 96 359 117 -369 -294 -249 - 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